A képviselőház igazságügyi bizottságának ülésén Semjén Zsolt és a DK-s képviselők között heves vita bontakozott ki az egyház és az állam kapcsolatáról, különösen a papi pedofília ügyében. Sebián-Petrovszki László DK-s alelnök a pedofília kérdését vetette fel, Semjén pedig a magyar kormány által létrehozott, szerinte Európa legszigorúbb pedofiltörvényére hivatkozott.
Semjén a kérdésre, hogy miért nem foglalkozik az egyházzal kapcsolatos, a világon bejelentett esetek százezredekhez képest töredék számú ügyekkel, az egyházzal kapcsolatos esetek kis számát és a 693 börtönben ülő pedofiltörvény szerinti elkövetőt hozta fel.
A miniszter szerint a hét pedofil-ügy, ami az elmúlt hetekben kiderült, mindössze a Kalocsa-kecskeméti Főegyházmegyében történt. Semjén szerint a Bese atya körüli botrány után több pedofil-ügy is előkerült, és Tóth Tamás akkori titkár, bár a kalocsai érsek nevében közleményt adott ki az ügyekre reagálva, az ügyekre való reagálás után lemondott pozíciójáról, és újabb ügyeket is kezdeményezett. Semjén azt állította, hogy Tóth Tamás ügyében nincs eltussolás, az ügyészség vizsgálja az ügyet.
A miniszter szerint nem érti, hogy az ellenzék miért foglalkozik az egyházzal, amikor nem érdekli őket a kánonjog. Semjén szerint az állam és az egyház kapcsolatában az alá-fölérendeltség nem fogadható el, és az együttműködés jó ütemben működik.
A politikus szerint az egyházi iskolákban jelentős túljelentkezés van, ami a magasabb színvonalnak köszönhető. Semjén véleménye szerint az állam és az egyház elválasztva van, de az egymásra épülés és az együttműködés a cél.
